前把价值200亿美元的黄金和珠宝偷偷运往了瑞士、奥地利、中国香港、中国台湾和新加坡等地。有人表示马科斯夫妇除了在美国购置房产以外，还把大量的钱存入了瑞士、美国、中国香港和菲律宾的银行，并在美国、英国、加拿大和菲律宾买了大量股票。中国香港方面指出马科斯夫妇有169亿英镑存入了中国香港的两家银行。1986年3月，美国冻结了马科斯在美国各地的资产，并将他随身行李的海关造册交给了菲律宾政府。这一份长达2300页的资产清单成了马科斯侵吞公款的有力证据。6月，应菲律宾政府的请求，瑞士政府冻结了马科斯在瑞士银行的存款，并将5亿美元转到了菲律宾的一个账户上。1988年10月，美国联邦法院以敲诈、勒索等罪名起诉了马科斯夫妇。大陪审团指控马科斯在总统任期内，挪用公款1.03亿美元，并从美国银行诈骗了1.65亿美元。追讨马科斯在世界各地的巨额资产是一项极其艰巨的工作，菲律宾政府不得不做好打持久战的准备。与此同时，马科斯家族统治的不少丑行开始被揭露出来，其中最具影响的就是重新调查阿基诺的被杀事迹经过3年多的调查审理，1990年，菲律宾法院判处空军准将卢瑟?库斯托迪奥和其他15名军官无期徒刑，并查明马科斯是这一暗杀事件的幕后主使。在菲律宾追讨公款的同时，背井离乡的马科斯夫妇为他们的**也付出了代价，他们在国际舆论的一片骂声中度日如年。过惯了被人前簇后拥生活的马科斯夫妇因为亲友的逐个离去而倍感凄凉和苦闷。由于1986年菲律宾吊销了他们全家的护照，他们落得有国不能归的下场。菲律宾总统阿基诺夫人表示，除非马科斯夫妇公开接受关于他侵吞和贪污国家财产的指控并退还大量非法所得，否则别指望回国。马科斯的妹妹、母亲先后去世，马科斯想回国参加葬礼，菲律宾以国家利益为重的理由拒绝了马科斯的请求。1989年9月28日，马科斯带着深深的遗憾凄凉地死在了夏威夷，马科斯留下遗言，要把他的尸体运回菲律宾安葬。马科斯去世后，政府不允许将他的灵柩运回国内，拉莫斯虽然允许自己的表兄魂归故里，但是却拒绝将其安葬在马尼拉的英雄陵园内。马科斯死后，美国联邦法院宣布不会指控伊梅尔达，菲律宾政府为了追回马科斯在国外的存款，也同意伊梅尔达回国。1993年，菲律宾廉政法院以贪污罪、**罪判处伊梅尔达9至12年的监禁，想借此剥夺她对马科斯存款的继承权。此后，伊梅尔达不断上诉，在寻找法律漏洞的同时，缴纳大笔保释金后，才幸免入狱。近20年来，针对马科斯家族的指控多达数百项，但仅追回了12.4亿美元现金，包括马科斯家族在瑞士银行的存款。目前，该家族在菲律宾境内仍有价值约40亿美元的财产由于指控被冻结，海外也有近8000万美元的资产遭到冻结。