研究和评价董仲舒最重要的依据和资料，就是他的著作。
《汉书·董仲舒传》云："仲舒所著，皆明经术之意，及上疏条教，凡百二十三篇。而说《春秋》事得失，《闻举》、《玉杯》、《著露》、《清明》、《竹林》之属，复数十篇，十余万言，皆传于后世。"《汉书·艺文志》则载董仲舒的著录有两种："公羊董仲舒治狱十六篇"和"董仲舒百二十三篇"。再则即是《汉书·董仲舒传》所载《天人三策》，以及散见于《汉书·食货志》中的两项上书，《五行志》中的"庙殿火灾对"及论灾异七十七事两项，《匈奴传》赞中的论御匈奴等资料和言论、著作。此外《后汉书·应勘传》还讲：董致仕家居，廷尉张汤亲至陋巷间得失，"于是作《春秋决狱》二百三十二事"。以上就是在汉代的史籍中所提到的董仲舒的主要著作。概括起来为以下八项：<一>"明经术之意及上疏条教"，百二十二篇；<二>"说《春秋》事得失，《闻举》、《玉杯》、《著露》、《清明》、《竹林》之属"，数十篇，十余万言；<三>《汉书·董仲舒传》所含《天人三策》；〈四〉《五行志》所载"庙殿火灾对"及论灾异七十六事；〈五〉《食货志》乞种麦、限田章；〈六〉《匈奴传》赞御匈奴；〈七〉"公羊董仲舒治狱"十六篇；〈八〉《春秋决狱》二百三十二事。
在汉朝之后的《隋书·经籍志》中，上面所述董仲舒的著录均未单列，而是仅仅开列了以下两种。
〈一〉"《春秋繁露》十六卷"；〈二〉"《春秋决事》十卷"。
这里所列两种著录与上述汉代所列著目有何关系？是将汉代所列著目全部包括无遗，抑是仅包括了部分篇目，或是另外两部独立的书目？从现有的《春秋繁露》来看，显然是仅包括了"说春秋事得失"数十篇中的大部，至于"明经术之意及上疏条教"的百二十三篇，则大部亡佚，可能只有少数几篇被收入其中。不过，因其书早已不存，其确切篇目和内容也就很难断定了。关于《春秋决事》，据宋王尧臣等所撰《崇文总目》云，似指因朝廷政议、张汤数问所作《春秋决狱》"二百三十二事"，不过王尧臣所见已"颇残逸"，"止有七十八事"了，其中是否包含《公羊董仲舒治狱》十六篇，则不得而知，当时又称《春秋决事比》。一般认为此书多为以《春秋》义断狱之判例。这里需要说明的是隋书《经籍志》中《春秋繁露》一书的来源。据与其同时的《西京杂记》说："董仲舒梦蛟龙入怀，乃作《春秋繁露》词。"这显系神秘主义的解释，纯属荒唐，而其书董仲舒"乃作??"，也属臆测，从《汉书》所列董仲舒的著作来看并无此书，因此对其所说完全不可信。我们只能推测其为后人辑录董仲舒的著作而成，并冠以《春秋繁露》的名称。而且据历史文献可知，《春秋繁露》作为经书正式列入《隋书》"经籍志"虽属首见，但这一书名在此之前已见于其他史籍。据《魏书》说隋志之将《春秋繁露》和《春秋决事》收入经部，乃因于梁阮孝绪之《七录》，即是说，最先著录此书者，至少可追溯至阮孝绪。同时另据梁刘昭之《〈后汉书·礼仪志〉注补》，也曾著录有《春秋繁露》之书名。由此足证该书至少在南北朝时已有流行。至于再往前，何人、何时辑录而成，我们就不得而知了。
此后，唐人所藏辑录有自东周迄于南齐的诗、赋、杂文二百六十首之《古文苑》，其中辑录了董仲舒的四篇著作：〈一〉《士不遇赋》〈二〉《诣丞相公孙弘记室书》〈三〉《郊祀对》〈四〉《雨雹对》《四库全书》"提要"云："《古文苑》二十一卷，不著编辑者名氏，书录解题称孙诛巨源于佛寺经龛中得之唐人所藏"。因此，其最初为何人、何时所辑以及所辑著作来源亦属未知之域。现在所见到的董仲舒著作，基本上即来源于