整体，不能单单从个人、政府、企业某一方面出发就得出结论，只有综合了各种因素的联系，进行宏观把握，才不至于“头疼医头、脚疼医脚”，为制定切实有效的宏观经济政策提供了正确的思路。
包括《灰市场理论》在内的三部作品在学界引起了极大反响。1991年，樊纲因其在《经济研究》1988年第8期上发表的论文《灰市场理论》获得第四届中国经济学的最高奖项——孙冶方经济科学奖 。
此外，《现代三大经济理论体系的比较与综合》被誉为中国大陆第一部对各种经济理论进行比较研究的专著，而《公有制宏观经济理论大纲》更是被冠以“中国经济学近50年发展史上具有标志性意义的专著”的美誉。一时间，樊纲在经济学界乃至社会各界声名鹊起，各种各样的荣誉也接踵而来。
1992年，樊纲破格晋升为中国社会科学院研究员，还被评为国家级有突出贡献的中青年专家；次年，他成为了社科院最年轻的博士生导师之一；这期间一直担任经济学杂志《经济研究》编辑部主任，1994年到1995年，任经济研究所副所长。现任中国经济体制改革研究会副会长、中国改革研究基金会秘书长、国民经济研究所所长。
除此之外，樊纲还在北京大学、南开大学、社科院等机构任教；2004年，樊纲被法国奥弗涅大学授予荣誉博士学位，同年还被《世界商业评论》评选为2004年度“中国最具影响力的10大经济学家”之一，并于2005年再度获得孙冶方经济科学奖；2005年，《南方人物周刊》将他评选为“中国魅力50人”之一；2004年及2008年，樊纲曾连续两度被英国《观点》（Prospect）杂志和美国《外交改策研究》（Foreign Policy）杂志评选为“全世界最受尊敬的100位公共知识分子”之一；2006年8月，樊纲就任新一届中国人民银行货币政策委员会委员，成为参与央行货币政策制定的学者型“平民专家”。